云上轉(zhuǎn)型正當(dāng)時，看亞馬遜云科技如何助力望石智慧實現(xiàn)破局

過去，新藥研發(fā)周期長達(dá)幾年甚至更長，但2020年以來，醫(yī)藥領(lǐng)域成為各界關(guān)注的焦點，原有的新藥研發(fā)速度已無法滿足當(dāng)下全球市場的需要，醫(yī)藥企業(yè)如何突破原有的業(yè)務(wù)瓶頸，提升藥物研發(fā)各環(huán)節(jié)的效率，成為未來發(fā)展業(yè)務(wù)發(fā)展重要影響因素之一。

望石智慧（StoneWise），成立于2018年，是一家使用人工智能技術(shù)驅(qū)動新藥研發(fā)的科技公司，希望以技術(shù)與創(chuàng)新的新視角打造世界領(lǐng)先的小分子創(chuàng)新藥研發(fā)平臺。

當(dāng)前，望石智慧匯聚了一批來自醫(yī)藥行業(yè)、人工智能、互聯(lián)網(wǎng)等領(lǐng)域的國內(nèi)外專家，他們基于對藥物研發(fā)行業(yè)的豐富認(rèn)知、創(chuàng)新的數(shù)據(jù)集成方法和強(qiáng)大的軟件與工程能力，搭建了以靶點口袋研究、分子生成、超高通量虛擬篩選、理性設(shè)計、成藥性優(yōu)化為核心的一體化技術(shù)平臺，旨在提升從苗頭化合物發(fā)現(xiàn)至臨床前候選化合物等新藥研發(fā)流程中多個關(guān)鍵環(huán)節(jié)的效率與成功率。

突破業(yè)務(wù)瓶頸

探索更多藥物研發(fā)可能

望石智慧自成立以來，憑借已被驗證的商業(yè)模式、扎實的技術(shù)根基、綜合的團(tuán)隊，已與國內(nèi)外高校、研究機(jī)構(gòu)、藥企達(dá)成廣泛的聯(lián)系與合作，并獲得了多個AI和醫(yī)藥領(lǐng)域一線投資機(jī)構(gòu)的認(rèn)可，但伴隨AI制藥的快速發(fā)展，其業(yè)務(wù)也面對多重轉(zhuǎn)型挑戰(zhàn)：

如何通過彈性、經(jīng)濟(jì)的算力降低開發(fā)成本？

藥物的早期發(fā)現(xiàn)，實際是如何盡可能探索更廣闊和更精準(zhǔn)的化學(xué)空間、定向性的生成和優(yōu)化，以便配出最契合靶點的“鑰匙”。目前共識的可成藥化學(xué)空間約為10^63，利用AI在如此廣闊的化學(xué)空間探索，且保證速度、精準(zhǔn)度和基于需求的定向性，是龐大的工程。在此過程中，經(jīng)常需要投遞數(shù)以千計的計算任務(wù)，依賴大量的CPU和GPU算力支撐，望石智慧需要預(yù)置和運維如此龐大規(guī)模的硬件設(shè)備，當(dāng)下則需要靈活性更高的解決方案，優(yōu)化成本。

如何管理數(shù)據(jù)并提升數(shù)據(jù)分析效率？

藥物研發(fā)作為一種數(shù)據(jù)密集型行業(yè)，與AI這種需要大量數(shù)據(jù)訓(xùn)練的特點相吻合，將AI應(yīng)用于藥物研發(fā)，一定程度可擺脫傳統(tǒng)的經(jīng)驗型藥物研發(fā)范式，提升新藥研發(fā)效率。AI/ML模型的開發(fā)需要大量醫(yī)藥數(shù)據(jù)進(jìn)行訓(xùn)練。

生物醫(yī)藥行業(yè)已積攢了大量的專利文獻(xiàn)等紙面數(shù)據(jù)，但這些數(shù)據(jù)面臨著數(shù)據(jù)化轉(zhuǎn)變的需求，包括了從紙面提取分子結(jié)構(gòu)、靶點、活性、基因、通路等“實體”和歸屬、導(dǎo)致、包含等“實體關(guān)系”，同時，并需要借ETL工具將相關(guān)數(shù)據(jù)進(jìn)行結(jié)構(gòu)化和歸一化處理，并寫入到HDFS、MySQL、Neo4j及ElasticSearch中作為基礎(chǔ)數(shù)據(jù)，搭建成數(shù)據(jù)庫，望石智慧希望借助AI，減少專家在IT和運維方面付出的經(jīng)歷，讓他們能更專注于數(shù)據(jù)的分析。

如何保障業(yè)務(wù)的安全與合規(guī)？

安全與合規(guī)，是一切業(yè)務(wù)開展的基礎(chǔ)，望石智慧需要綜合考慮滿足國內(nèi)國外的多重安全合規(guī)要求。通過不斷提升在架構(gòu)層、應(yīng)用層和數(shù)據(jù)層的安全保障能力，構(gòu)建可預(yù)警、可追溯、可審計的機(jī)制。

全面技術(shù)加持

不斷突破技術(shù)挑戰(zhàn)

云計算作為大數(shù)據(jù)、AI、IoT等技術(shù)的基礎(chǔ)，可在人工智能驅(qū)動的新藥研發(fā)業(yè)務(wù)場景中，提供強(qiáng)大的算力支撐。在選擇云服務(wù)提供商時，望石智慧通過綜合評估，選擇采用亞馬遜云科技的主要基于以下多重技術(shù)優(yōu)勢：

豐富而敏捷的服務(wù)能夠滿足不同業(yè)務(wù)需要。

結(jié)合Amazon EC2預(yù)留、按需和Spot實例，可充分支持其在藥物篩選與新藥研發(fā)過程中的密集的計算需求，并在最高可節(jié)省成本達(dá)90%的同時獲得海量算力，為任務(wù)處理提供更彈性、靈活的選擇。

完善的安全合規(guī)能力與生態(tài)體系。

亞馬遜云科技不僅能提供Amazon Identity and Access Management(IAM)、Amazon Key Management Service(KMS)、Amazon WAF等安全類服務(wù)，同時借助亞馬遜云科技Marketplace可以自由選擇第三方專業(yè)安全服務(wù)商的接入，可以通過AMI鏡像、SaaS或API接口等方式快速部署，非常靈活，用戶選擇自由度也比較高；合規(guī)性方面，亞馬遜云科技還擁有國內(nèi)外很多合規(guī)認(rèn)證與法規(guī)聲明，并能提供部署的白皮書、最佳實踐指導(dǎo)等，為望石智慧在國內(nèi)和海外開展業(yè)務(wù)奠定了良好的基礎(chǔ)。

高集成度與高部署效率支撐的數(shù)據(jù)處理與分析能力。

借助Amazon S3 Intelligent-Tiering智能分層服務(wù)，來存儲和管理數(shù)據(jù)的生命周期，并能在Amazon Athena中使用標(biāo)準(zhǔn)的SQL語言直接對Amazon S3上的數(shù)據(jù)進(jìn)行交互式查詢，而無需關(guān)注服務(wù)器與基礎(chǔ)環(huán)境。此外，使用ETL抽取服務(wù)Amazon Glue、關(guān)系型數(shù)據(jù)庫托管服務(wù)Amazon RDS等，都大幅提高了數(shù)據(jù)管理和數(shù)據(jù)分析效率。

專業(yè)的服務(wù)團(tuán)隊讓云原生部署更加高效。

亞馬遜云科技不僅為望石智慧提供了豐富的產(chǎn)品服務(wù)和完備的技術(shù)文檔，還派駐專業(yè)的合作伙伴與技術(shù)團(tuán)隊為望石智慧提供相關(guān)的技術(shù)支持，望石智慧僅用了3個月，就基于Amazon Batch服務(wù)快速建立了一套靈活的任務(wù)投遞機(jī)制，應(yīng)用于不同規(guī)模的小分子高通量篩選，實現(xiàn)云原生的業(yè)務(wù)部署。

強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)合

開啟藥物研發(fā)新“視”界

望石智慧內(nèi)部體系化研發(fā)平臺和StoneMIND?等多個核心業(yè)務(wù)部署至亞馬遜云科技，獲得了多方的業(yè)務(wù)成效：

海量算力支撐

通過引入無服務(wù)器化的云上托管服務(wù)讓望石智慧能夠在保障業(yè)務(wù)的同時降低成本支出，還為任務(wù)處理提供更彈性、靈活的選擇；在亞馬遜云科技算力的支持下，當(dāng)前望石智慧可在20-30分鐘內(nèi)，提供數(shù)萬核CPU和數(shù)十塊GPU算力，來支撐數(shù)千任務(wù)的投遞和計算，并在幾小時—幾天內(nèi)完成計算任務(wù)。

從業(yè)務(wù)上，望石智慧在有效平衡速度和精度的前提下，實現(xiàn)低成本完成億級別/小時化合物庫的超高通量虛擬篩選；基于靶點口袋的三維結(jié)構(gòu)或者參考分子，快速實現(xiàn)百萬至千萬級別化合物的從頭生成，有效支持全新靶點和跟隨式創(chuàng)新靶點的活性分子骨架的發(fā)現(xiàn)，以及基于大量SPR參考的分子定向優(yōu)化等業(yè)務(wù)突破。

優(yōu)化數(shù)據(jù)處理與分析能力

使用Amazon S3 Intelligent-Tiering智能分層服務(wù)、Amazon Athena智能交互SQL查詢服務(wù)、Amazon Glue數(shù)據(jù)抽取服務(wù)以及RDS數(shù)據(jù)庫托管服務(wù)、Amazon Redshift數(shù)據(jù)倉庫等服務(wù)，望石智慧搭建了龐大的醫(yī)藥數(shù)據(jù)庫來支撐AI分子設(shè)計軟件StoneMIND?Designer、化學(xué)分子的識別工具StoneMIND?Collector等藥物發(fā)現(xiàn)過程中的AI工具對外提供服務(wù)。目前，在工業(yè)端和學(xué)術(shù)界已有過萬活躍用戶及多家頭部藥企的使用。

高效、安全完成全球化基礎(chǔ)架構(gòu)部署

在安全與合規(guī)性層面，望石智慧采用了包括Amazon WAF在內(nèi)的一系列安全服務(wù)，并與亞馬遜云科技合作伙伴安恒、光環(huán)有云一起構(gòu)建了VPN、堡壘機(jī)、主機(jī)防護(hù)、數(shù)據(jù)庫審計等多方位的安全防護(hù)機(jī)制，實現(xiàn)了全球業(yè)務(wù)發(fā)展的合規(guī)要求。望石智慧基于亞馬遜云科技的服務(wù)與實踐經(jīng)驗，已獲得了ISO27001信息安全管理體系認(rèn)證，并完成了網(wǎng)絡(luò)等級安全保護(hù)三級測評。

“在與亞馬遜云科技的合作中，我們獲得了技術(shù)、商務(wù)、醫(yī)療行業(yè)專家、生態(tài)伙伴、云創(chuàng)計劃及市場等多團(tuán)隊的支持，加速了平臺與SaaS的研發(fā)和迭代效率，同時還為基于底層理論創(chuàng)新的應(yīng)用開發(fā)提供了多維度的支持?！?/p>

—北京望石智慧科技有限公司CEO周杰龍

未來，望石智慧將會圍繞算法、數(shù)據(jù)、算力與亞馬遜云科技在國內(nèi)外展開更多、更深入的合作，旨在進(jìn)一步加速在新藥發(fā)現(xiàn)領(lǐng)域中的應(yīng)用等。

關(guān)于杭州安恒信息技術(shù)股份有限公司

杭州安恒信息技術(shù)股份有限公司，作為亞馬遜云科技合作伙伴，可為用提供一站式的等保合規(guī)解決方案及服務(wù)，支持本地、混合云或多云的云安全建設(shè)，并能靈活的提供SaaS、軟件鏡像的交付模式，多年來堅持用云的方式做安全，已經(jīng)累計為數(shù)十萬用戶提供云上安全服務(wù)，是云上安全的不二之選。

關(guān)于光環(huán)有云

光環(huán)有云，作為亞馬遜云科技合作伙伴，旨在為廣大企業(yè)客戶打造領(lǐng)先的、適合中國市場需求的基于亞馬遜云科技的云服務(wù)產(chǎn)品和混合云資源，加速客戶向云端遷移，實現(xiàn)企業(yè)的數(shù)字化轉(zhuǎn)型。同時光環(huán)有云針對客戶對混合云的需求，為企業(yè)用戶上云提供咨詢、集成、遷移及運維服務(wù)，并幫助客戶培養(yǎng)人才和提供技術(shù)支持。